Према извештајима ФДА, најчешћи нежељени ефекти семаглутида укључују мучнину, дијареју, повраћање, затвор, бол у стомаку, надимање, вртоглавицу, главобољу, лоше варење, хипогликемију, гастроентеритис и гастроезофагеалну рефлуксну болест.

У озбиљнијим случајевима, семаглутид може изазвати панкреатитис, камен у жучи, акутну повреду бубрега, оштећење мрежњаче и убрзан рад срца.

Људи који узимају семаглутид имају 4,6 пута већу инциденцу панкреатитиса од оних који узимају друге врсте{1}}лекова за мршављење, а такође је повезан са повећаном инциденцом гастропарезе.